Qua thanh tra đã chỉ ra không ít tồn tại, hạn chế, sai phạm sau: Công tác thực hiện kế hoạch đầu tư công nguồn vốn ngân sách Trung ương, vốn ngân sách địa phương tỉnh quản lý, tỷ lệ giải ngân của thành phố đạt thấp, dẫn đến phải huỷ bỏ hoặc chuyển nguồn sang năm sau đã làm giảm hiệu quả sử dụng vốn đầu tư công.

Theo lý giải của UBND TP Điện Biên Phủ kết quả giải ngân đạt thấp xuất phát từ nhiều nguyên nhân khách quan như ảnh hưởng của thời tiết, khí hậu; khối lượng công việc đền bù, giải phóng mặt bằng lớn, vướng mắc cơ chế chính sách; một số người dân trong vùng dự án có đất bị thu hồi chưa đồng tình với chính sách đền bù, hỗ trợ; các quy định của pháp luật về thủ tục, hồ sơ về đất đai, đo đạc, quy chủ phức tạp; do vướng mắc trong công tác đấu giá đất, dẫn đến chưa có vốn thanh toán khối lượng hoàn thành tại một số dự án. 

Theo cơ quan thanh tra, UBND thành phố, chủ đầu tư và các đơn vị có liên quan cũng có trách nhiệm trong việc thực hiện công tác chuẩn bị đầu tư và bố trí nhân lực thực hiện, chưa lường trước những khó khăn gặp phải trong quá trình triển khai thực hiện dự án đã dẫn đến tỷ lệ giải ngân đạt thấp. 

Qua thanh tra cho thấy, tại các dự án sử dụng nguồn vốn thu từ sử dụng đất và đấu giá đất, một số dự án đến hết năm 2023 vẫn còn nợ đọng vốn đầu tư xây dựng cơ bản. 

Bên cạnh đó, UBND thành phố và các chủ đầu tư chưa thực hiện nghiêm túc việc báo cáo giám sát, đánh giá chi tiết cho từng dự án theo quy định. 

Tiến hành kiểm tra, xác minh việc chấp hành pháp luật về đầu tư công, công tác đấu thầu xác định, việc công khai kết quả lựa chọn nhà thầu theo quy trình rút gọn lên hệ thống mạng đấu thầu quốc gia hoặc báo đấu thầu tại các dự án còn chưa đầy đủ. Quy trình lập, thẩm định, phê duyệt kế hoạch lựa chọn nhà thầu được phân cấp cho xã, phường thực hiện chưa đảm bảo. Trách nhiệm đối với các hạn chế nêu trên thuộc về UBND thành phố, các phòng chuyên môn thuộc UBND thành phố và các đơn vị được giao nhiệm vụ chủ đầu tư.

Thanh tra Sở Kế hoạch và Đầu tư đề nghị UBND TP Điện Biên Phủ và các tổ chức, đơn vị có liên quan tổ chức họp rút kinh nghiệm và khẩn trương khắc phục với những tồn tại, hạn chế được chỉ ra qua thanh tra. UBND thành phố rà soát và tìm hướng giải quyết dứt điểm tình trạng nợ đọng vốn xây dựng cơ bản. Các chủ đầu tư có trách nhiệm xử lý về kinh tế tổng số tiền sai phạm, gần 131 triệu đồng.