Theo đó, Thanh tra Chính phủ kiến nghị chuyển 2 nội dung gồm: Việc Khu Liên hợp thể thao quốc gia (Khu LHTTQG) cho thuê mặt bằng các khu đất đã giải phóng mặt bằng (GPMB) đang chờ thực hiện dự án vi phạm quy định của pháp luật về đất đai, pháp luật về quản lý sử dụng tài sản nhà nước, tài sản công, thuộc đối tượng phải nộp tiền thuê đất nhưng chưa nộp NSNN số tiền lớn, có dấu hiệu gây thất thu tiền NSNN.

Việc Khu LHTTQG sử dụng đất thực hiện hợp đồng hợp tác đầu tư trạm phân phối gas với Công ty TNHH Tân An Bình trong khuôn viên Cung thể thao dưới nước vi phạm quy định của pháp luật về đất đai, pháp luật về quản lý sử dụng tài sản nhà nước, tài sản công, thuộc đối tượng phải nộp tiền thuê đất nhưng chưa nộp NSNN, có dấu hiệu gây thất thu tiền NSNN.

Thanh tra Chính phủ cũng yêu cầu Khu Liên hợp thể thao quốc gia xử lí về kinh tế với tổng số tiền sai phạm là 776.945,962 triệu đồng.

Cụ thể: Giảm trừ quyết toán và thu hồi số tiền 3.840,078 triệu đồng từ các đơn vị thi công 03 dự án (Cải tạo nhà bảo tàng Olympic thành nhà làm việc mới; Cải tạo nền sân điền kinh Sân vận động trung tâm, cải tạo mặt sân có sẵn tập số 2).

Nộp ngân sách nhà nước số tiền thuê đất còn phải nộp và số tiền chậm nộp (giai đoạn 2009 - 2018) của: 05 điểm đất thực hiện dự liên doanh, liên kết với số tiền 46.383,022 triệu đồng; diện tích đất 865 m2 sử dụng hợp tác đầu tư với Công ty TNHH Tân An Bình xây dựng trạm phân phối gas với số tiền là 1.940,548 triệu đồng; các khu đất đã GPMB đang chờ thực hiện dự án sử dụng cho thuê mặt bằng với số tiền 658.321,552 triệu đồng (nộp về Chi cục thuế quận Nam Từ Liêm).

Đối với số tiền thuê đất phải nộp năm 2018 là 22.620,974 triệu đồng trong tổng số tiền 658,321,552 triệu đồng nêu trên, Khu LHTTQG có trách nhiệm làm việc với các doanh nghiệp đã ký hợp đồng thuê mặt bằng trong năm 2018 để thu tiền thuê đất của các doanh nghiệp theo thỏa thuận trong hợp đồng cho thuê mặt bằng đã ký để nộp ngân sách nhà nước.

Thu hồi số tiền 3.740,597 triệu đồng (từ các cá nhân, đơn vị: Nguyên Giám đốc, nguyên Phó Giám đốc phụ trách, Trưởng phòng Kế hoạch Kinh doanh, Công đoàn Khu LHTTQG, Phòng Quản lý Cung thể thao dưới nước), hạch toán vào doanh thu của Khu LHTTQG....Giảm trừ quyết toán, thu hồi số tiền sai phạm từ các doanh nghiệp, không để xảy ra thiệt hại, thất thoát nguồn vốn nhà nước.

Về xử lý hành chính, Thanh tra Chính phủ yêu cầu Bộ VHTTDL tổ chức kiểm điểm làm rõ và xử lí trách nhiệm của tập thể, cá nhân có liên quan đến sai phạm, vi phạm của Khu LHTTQG...

Bộ VHTTDL chỉ đạo Khu LHTTQG kiểm điểm, xử lý trách nhiệm đối với tập thể lãnh đạo, xử lý trách nhiệm đồng thời xử lý kỷ luật nghiêm minh theo quy định của pháp luật đối với Giám đốc Khu LHTTQG, Phó Giám đốc Khu LHTTQG (theo từng thời kỳ trong giai đoạn 2009-2018) có liên quan đến các thiếu sót, khuyết điểm, vi phạm, sai phạm của Khu LHTTQG.

Giám đốc Khu LHTTQG chỉ đạo, tổ chức kiểm điểm, xử lý trách nhiệm đối với tập thể các Phòng Kế hoạch Kinh doanh, Phòng Quản lý dự án, Phòng Tài vụ, Phòng Quản lý Công trình thiết bị, Phòng Quản lý Sân vận động, Phòng Quản lý Cung thể thao dưới nước; xử lý trách nhiệm đồng thời xử lý kỷ luật nghiêm minh theo quy định của pháp luật đối với: Trưởng phòng Kế hoạch Kinh doanh, Trưởng phòng Quản lý Công trình thiết bị, Trưởng phòng Quản lý Sân vận động, Trưởng phòng Quản lý dự án và các cá nhân của Khu LHTTOG (theo từng thời kỳ trong giai đoạn 2009 - 2018) có liên quan đến thiếu sót, khuyết điểm, vi phạm, sai phạm.

Ngày 24/5/2021, Văn phòng Chính phủ có Văn bản số 1098/VPCP-VI thông báo ý kiến chỉ đạo của Phó Thủ tướng Thường trực Chính phủ Trương Hòa Bình đối với Kết luận thanh tra, trong đó có nội dung: Đồng ý kiến nghị của Thanh tra Chính phủ tại Kết luận thanh tra số 106/KL-TTCP ngày 11/5/2021 về thanh tra toàn diện việc chấp hành quy định của pháp luật về công tác quản lý, sử dụng đất đai, tài sản công tại Khu Liên hợp thể thao quốc gia; Giao Bộ Văn hóa, Thể thao và Du lịch, Bộ Tài chính, Ủy ban nhân dân Thành phố Hà Nội, Tổng cục Thể dục thể thao, Khu Liên hợp thể thao quốc gia, Cục thuế Thành phố Hà Nội thực hiện các kiến nghị nêu tại Kết luận thanh tra của Thanh tra Chính phủ và Thanh tra Chính phủ kiểm tra, giám sát việc thực hiện sau thanh tra theo quy định của pháp luật.