R 12 NineT được xây dựng trên nền tảng khung sườn ống liền khối, với khung sau tích hợp sẵn nhiều vị trí bắt vít, cung cấp khả năng cá nhân hóa tối ưu.
R 12 NineT có yên solo với đuôi xe ngắn tích hợp đèn hậu LED và pad biển số phía sau. Phần yên làm dày hơn so với R NineT và có thêm đệm lưng phía sau ốp yên solo. Bên dưới giảm xóc sau được che đi bằng các tấm ốp hông, thay vì để lộ ra như chiếc R NineT hiện tại.
Bình xăng của R12 nineT được sơn đen làm tăng thêm phần cổ điển và vị trí người lái kẹp hai chân vào bình xăng được thiết kế lõm xuống. Hình dáng bình xăng được làm gồ cao hơn bình xăng R NineT nhưng không dài bằng.
R 12 NineT cũng được trang bị đèn pha tròn đậm chất hoài cổ kết hợp với dải LED định vị nằm chính giữa.
Chưa dừng lại ở đó, chất retro của chiếc xe còn được tăng lên khi sở hữu bảng đồng hồ analog đôi với 1 bên hiển thị tốc độ và 1 bên hiển thị vòng tua.
Hệ thống giảm xóc trang bị cho R 12 NineT gồm phuộc trước USD của Marzocchi đi kèm 2 kẹp phanh 4 piston lắp hướng tâm. Toàn bộ bánh trước sau của BMW R 12 NineT đều được bọc bên ngoài bộ lốp Michelin Road 5.