Về ngoại thất, xe sở hữu màu sơn ngoại thất xanh trắng bắt mắt nhưng đã được loại bỏ hệ thống đèn chiếu sáng. Mẫu mô tô này sẽ hướng đến những người muốn sở hữu chiếc Yamaha R1 sang trọng nhất.
Hãng xe Nhật Bản cho biết phiên bản R1 GYTR lần này sở hữu các trang bị thiết yếu cho một cuộc đua như ống xả Akrapovic full-system đi kèm với ốp GB Racing để bảo vệ lốp máy ở hai bên động cơ.
Ngoài ra xe còn có, một ECU riêng, hệ thống ABS GYTR và bộ khóa an toàn thay cho chìa khóa cơ. R1 GYTR được trang bị động cơ CP4 4 xi-lanh, dung tích 998cc, hậu duệ của chiếc xe đua M1 từng đoạt giải MotoGP.
Bên cạnh đó, hệ thống phanh cũng như toàn bộ dây dầu cao su được thay thế bằng dây kim loại đi kèm với phần piston bên trong kẹp phanh sử dụng chất liệu thép.
Bên cạnh đó là một vài trang bị như nắp bình xăng, ghi đông và chảng ba GYTR, chắn xích Shark Fin, bảo vệ tay phanh, gác chân có thể tùy chỉnh,….