Theo báo Granma của Cuba, trong vụ án hình sự đầu tiên, ông bị buộc tội về tội gián điệp, hành vi gây tổn hại đến hoạt động kinh tế hoặc hợp đồng; cũng như hối lộ, trộm cắp và làm hư hỏng tài liệu... trong sự quản lý chính thức và một số tội danh khác. Với mức án như vậy, Tòa án đã tuyên phạt ông mức án tù chung thân.
Trong phiên tòa thứ hai, ông bị kết tội liên tục nhận hối lộ để đạt mục đích làm giả tài liệu công; cũng như tội môi giới ảnh hưởng và trốn thuế, cả hai đều có tính chất liên tục. Trong trường hợp này, Tòa án đã tuyên phạt ông mức án chung là 20 năm tù giam.
Trong cả hai phiên tòa xét xử ông Gil Fernández, các biện pháp trừng phạt bổ sung đã được áp dụng, bao gồm tịch thu tài sản, cấm thực hiện các chức năng liên quan đến quản lý... và nhiều biện pháp khác.
Theo báo Granma trích dẫn cáo trạng, ông Alejandro Miguel Gil Fernández, thông qua các hành vi tham nhũng và gian dối, đã lạm dụng quyền hạn được giao phó để trục lợi cá nhân, nhận tiền từ các công ty nước ngoài và hối lộ các quan chức nhà nước khác để hợp pháp hóa việc mua bán tài sản.
