Trong đó, bị can Lê Quang Thung (SN 1946), cựu quyền Chủ tịch HĐQT Tập đoàn Cao su Việt Nam, bị truy tố về các tội: "Nhận hối lộ" và "Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản Nhà nước gây thất thoát, lãng phí". Bị can Trần Ngọc Thuận, cựu Tổng Giám đốc Tập đoàn Cao su Việt Nam, bị truy tố về tội "Nhận hối lộ".
Trong vụ án này, bị can Lê Y Linh, cựu Giám đốc Công ty TNHH Việt Tín và Đặng Phước Dừa, cựu Chủ tịch HĐQT Công ty CP Việt Tín, bị đề nghị truy tố tội "Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản Nhà nước gây thất thoát, lãng phí" và "Đưa hối lộ". Bị can Võ Sỹ Lực, cựu Chủ tịch HĐTV Tập đoàn Cao su Việt Nam và Nguyễn Thị Như Loan (66 tuổi), cựu Chủ tịch HĐQT Công ty Quốc Cường Gia Lai, bị truy tố về tội "Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản Nhà nước gây thất thoát, lãng phí".
Bị can Nguyễn Thị Hồng, cựu Phó Chủ tịch UBND TP.HCM, Phó Trưởng ban Chỉ đạo 09 TP.HCM và Đào Thị Hương Lan, cựu Giám đốc Sở Tài chính, Ủy viên Thường trực Ban Chỉ đạo 09 TP.HCM, bị đề nghị truy tố tội "Lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ".
Theo cáo trạng, trong quá trình thực hiện phương án xử lý, sắp xếp khu đất tại địa chỉ số 39-39B Bến Vân Đồn (phường Xóm Chiếu, tháng 12/2009), bị can Lê Quang Thung thỏa thuận, thống nhất với bị can Lê Y Linh và bị can Đặng Phước Dừa về việc Tập đoàn Cao su sẽ chuyển nhượng khu đất cho Linh, Dừa.
Cụ thể, bị can Thung thỏa thuận với Linh, Dừa thành lập Công ty Phú Việt Tín, chuyển nhượng vốn góp nhưng bản chất là chuyển nhượng 99% giá trị khu đất 39-39B Bến Vân Đồn không qua định giá, đấu giá. Sau đó, bị can Thung chỉ đạo cấp dưới thành lập Công ty Phú Việt Tín; đề nghị UBND TP.HCM thu hồi, giao đất cho Công ty Phú Việt Tín để thực hiện dự án. Từ đó, chuyển nhượng 99% vốn tại Công ty Phú Việt Tín… tạo điều kiện cho công ty của Linh, Dừa nắm quyền chi phối.
Trước khi nghỉ hưu, Thung trao đổi và nhờ Trần Ngọc Thuận tiếp tục tạo điều kiện cho Linh, Dừa được nhận chuyển nhượng khu đất 39-39B Bến Vân Đồn không qua thẩm định giá, đấu giá. Trong quá trình này, Thung thỏa thuận nhận 3 triệu USD và thực tế đã nhận 200.000 đô la Singapore cùng 300.000 USD từ Linh, Dừa.
Khoảng tháng 11/2013, bị can Nguyễn Thị Như Loan liên hệ với Linh, Dừa đặt vấn đề mua và được cung cấp thông tin, tài liệu về khu đất. Bà Loan biết đất có nguồn gốc công sản, đã có quyết định giao đất cho Công ty Phú Việt Tín nhưng chưa nộp tiền sử dụng đất nên chưa được cấp Giấy chứng nhận quyền sử dụng đất; dự án chưa có giấy chứng nhận đầu tư và chưa triển khai xây dựng; khu đất vẫn do hai công ty cao su quản lý, sử dụng.
Tuy nhiên, ngày 06/12/2013, bà Loan vẫn ký hợp đồng hứa chuyển nhượng vốn góp với Đặng Phước Dừa, thống nhất giá mua khu đất là 460,9 tỷ đồng (bao gồm cả tiền sử dụng đất). Bà Loan đã chuyển cho Linh, Dừa 50 tỷ đồng tiền đặt cọc và 186,1 tỷ đồng để nộp tiền sử dụng đất nhưng được hợp thức hóa bằng hợp đồng vay tiền.
Khi biết Linh, Dừa chưa trả tiền mua vốn góp cho Cao su Đồng Nai và Cao su Bà Rịa nên chưa có căn cứ pháp lý chuyển nhượng cổ phần, bà Loan tiếp tục chuyển 65 tỷ đồng cho Dừa để thanh toán cho phía Côngty Cao su. Từ nguồn tiền này, Linh và Dừa đã mua 99% vốn góp tại Công ty Phú Việt Tín rồi chuyển nhượng toàn bộ cho bà Loan.
Đối với 1% vốn góp còn lại, bị can Nguyễn Thị Như Loan trực tiếp liên hệ và mua từ Cao su Đồng Nai và Cao su Bà Rịa không qua đấu giá mà theo giá được ấn định từ năm 2010 là 950 USD/m².
Trước khi sở hữu 100% vốn góp tại Công ty Phú Việt Tín, bà Như Loan đã thống nhất với Tập đoàn Novaland bán lại dự án với tổng giá trị là hơn 846 tỷ đồng. Trừ đi chi phí đầu tư hơn 464 tỷ đồng, Công ty Quốc Cường Gia Lai hưởng lợi số tiền gần 382 tỷ đồng. Sau khi trừ các chi phí khác, cá nhân bị can Nguyễn Thị Như Loan hưởng lợi bất chính số tiền 297,8 tỷ đồng.
