Theo thông tin từ cơ quan chức năng, vào khoảng 11h45 trưa 18/5 (giờ địa phương), hai kẻ tấn công đã nổ súng khiến ít nhất ba người đàn ông thiệt mạng tại hiện trường. Ngay sau khi thực hiện hành vi tội ác, hai nghi phạm được xác định là nam giới ở độ tuổi 17 và 19, cũng đã tử vong do tự sát bằng súng. Cảnh sát trưởng San Diego, ông Scott Wahl, cho biết vụ việc đang được điều tra theo hướng một tội ác do thù ghét.
Lực lượng cảnh sát đã có mặt tại hiện trường chỉ trong vòng bốn phút sau khi nhận được tin báo. Hàng loạt tuyến đường quanh khu vực trung tâm Hồi giáo bị phong tỏa, bao gồm đại lộ Balboa cùng nhiều tuyến đường kết nối với xa lộ I-805.
Trong khi đó, một số trường học trong khu vực đã được đặt trong tình trạng phong tỏa tạm thời và người dân xung quanh được khuyến cáo nên trú ẩn tại chỗ để đảm bảo an toàn.
Ngoài ra, cơ quan chức năng cũng ghi nhận một vụ nổ súng khác cách hiện trường chính vài dãy nhà, nhắm vào một người thợ làm vườn nhưng may mắn là người này không bị trúng đạn.
Cục Điều tra Liên bang Mỹ (FBI) cũng đã có mặt tại hiện trường để phối hợp điều tra. Đặc vụ phụ trách FBI Mark Remily cho biết cơ quan này đang “đánh giá tình hình một cách kỹ lưỡng” và “sẽ làm việc không ngừng nghỉ cho tới khi tìm ra sự thật".
Trung tâm Hồi giáo San Diego đã thông báo trên mạng xã hội rằng toàn bộ giáo viên và học sinh đã được sơ tán an toàn và kêu gọi cộng đồng cùng cầu nguyện cho những người gặp nạn.
Thị trưởng San Diego Todd Gloria cho biết ông cầu nguyện cho cộng đồng Hồi giáo tại thành phố. “Không nguồn lực nào sẽ bị tiết kiệm khi chúng tôi bảo vệ các cơ sở tôn giáo”, ông Gloria nói.
Tổng thống Mỹ Donald Trump cũng đã được báo cáo về vụ việc và gọi đây là “một tình huống khủng khiếp”.