Ông Hernandez, người giữ cương vị Tổng thống Honduras trong hai nhiệm kỳ từ năm 2014 đến 2022, đáp chuyến bay riêng xuống sân bay quốc tế Palmerola, cách thủ đô Tegucigalpa khoảng 60 km về phía tây bắc. Đón ông có nhiều thành viên trong gia đình, trong đó có mẹ, các con gái và vợ là bà Ana Garcia.
Sau khi xuống máy bay, cả gia đình quỳ cầu nguyện trên đường băng trước khi vẫy chào hàng trăm người ủng hộ đến đón ông, rồi tiếp tục di chuyển bằng đường hàng không về Tegucigalpa.
Dù đã được Mỹ ân xá, ông Hernandez vẫn phải đối mặt với các cáo buộc trong nước. Cựu Tổng thống Honduras dự kiến ra hầu tòa vào ngày 3/8 với các cáo buộc gian lận và rửa tiền. Lệnh bắt giữ đối với ông đã được tạm đình chỉ từ tháng 6 nên ông không bị bắt ngay khi trở về.
Đầu tháng này, ông đã chia sẻ trên mạng xã hội X: "Tôi không thể diễn tả hết cảm xúc và niềm hạnh phúc sâu sắc trong tim khi được trở về quê hương". Ông cũng chia sẻ: "Điều đó không hề dễ dàng. Quá trình này vô cùng khó khăn... và những gì tôi trải qua trong tù, tôi thực sự không mong bất kỳ ai phải chịu đựng".
Ông Hernandez bị bắt tại Tegucigalpa vào tháng 2/2022 và bị dẫn độ sang Mỹ hai tháng sau đó. Năm 2024, một thẩm phán Mỹ tuyên phạt ông 45 năm tù vì các tội danh liên quan đến buôn bán ma túy và vũ khí, những cáo buộc mà ông luôn bác bỏ.
Lệnh ân xá do ông Trump ban hành vào cuối năm 2025, trong bối cảnh cuộc bầu cử tổng thống Honduras diễn ra căng thẳng, đã làm dấy lên chỉ trích về việc Mỹ can thiệp vào tiến trình chính trị của nước này.
Theo cuộc điều tra tham nhũng mang tên "Pandora II" tại Honduras, ông Hernandez cùng nhiều cựu quan chức cấp cao bị cáo buộc biển thủ gần 11 triệu USD từ ngân sách nhà nước để phục vụ các chiến dịch chính trị giai đoạn 2010–2013, trong đó có chiến dịch tranh cử tổng thống của ông.
Ông Hernandez cho biết không loại trừ khả năng quay trở lại chính trường trong tương lai, dù khẳng định đây chưa phải kế hoạch trước mắt. Ông nói: "Đảng của chúng tôi hiện đã có một thế hệ lãnh đạo mới và chúng tôi muốn ủng hộ họ".