Trong dự thảo Nghị định quy định chi tiết thi hành một số điều của Luật Thuế tiêu thụ đặc biệt, Bộ Tài chính đề xuất: Đối với các doanh nghiệp được phép sản xuất, pha chế xăng sinh học, việc kê khai nộp thuế, khấu trừ thuế tiêu thụ đặc biệt được thực hiện tại cơ quan thuế địa phương nơi doanh nghiệp đóng trụ sở chính.
Số thuế tiêu thụ đặc biệt chưa được khấu trừ hết của xăng khoáng nguyên liệu dùng để sản xuất, pha chế xăng sinh học được bù trừ với số thuế tiêu thụ đặc biệt phải nộp của hàng hóa, dịch vụ khác phát sinh trong kỳ.
Trường hợp sau khi bù trừ, còn số thuế tiêu thụ đặc biệt chưa được khấu trừ hết của xăng khoáng nguyên liệu dùng để sản xuất, pha chế xăng sinh học thì được khấu trừ vào kỳ tiếp theo hoặc hoàn trả theo quy định của Bộ Tài chính.
Tại Nghị định số 14/2019/NĐ-CP đã quy định về việc hoàn trả số thuế tiêu thụ đặc biệt chưa được khấu trừ hết của doanh nghiệp sản xuất xăng sinh học.
Tại Thông tư số 80 ngày 29/9/2021 của Bộ Tài chính hướng dẫn thi hành một số điều của Luật Quản lý thuế và Nghị định số 126/2020/NĐ-CP quy định chi tiết một số điều của Luật Quản lý thuế đề cập đến Hồ sơ đề nghị hoàn thuế tiêu thụ đặc biệt đối với xăng sinh học
Theo đó, hồ sơ gồm: Giấy đề nghị hoàn trả khoản thu ngân sách nhà nước và bản sao Văn bản của cơ quan nhà nước có thẩm quyền về việc người nộp thuế được sản xuất xăng sinh học, nộp theo hồ sơ hoàn thuế tiêu thụ đặc biệt lần đầu.
Theo Bộ Tài chính, căn cứ dự thảo Nghị định nêu trên và kế thừa quy định hiện hành đang được thực hiện ổn định, cần quy định hồ sơ hoàn trả số thuế tiêu thụ đặc biệt chưa được khấu trừ hết của các doanh nghiệp sản xuất xăng sinh học.
Cũng trong dự thảo này, Bộ Tài chính đề xuất quy định về hồ sơ, thủ tục hoàn trả số thuế tiêu thụ đặc biệt chưa được khấu trừ hết của các doanh nghiệp sản xuất xăng sinh học.
Đối với các doanh nghiệp được phép sản xuất xăng sinh học, hồ sơ giải quyết hoàn trả thuế tiêu thụ đặc biệt, bao gồm: Đề nghị hoàn trả khoản thu ngân sách nhà nước kiêm bù trừ với các khoản thuế phải nộp khác (nếu có).
Doanh nghiệp sản xuất, pha chế xăng sinh học gửi hồ sơ đề nghị hoàn trả số thuế tiêu thụ đặc biệt chưa được khấu trừ hết đến cơ quan thuế địa phương nơi doanh nghiệp đóng trụ sở chính để được giải quyết hoàn trả theo quy định.
Trách nhiệm của cơ quan quản lý thuế trong việc giải quyết hồ sơ hoàn trả số thuế tiêu thụ đặc biệt theo quy định tại khoản này được thực hiện theo quy định của pháp luật về quản lý thuế.
Căn cứ lệnh hoàn trả khoản thu ngân sách nhà nước của cơ quan thuế hoặc lệnh hoàn trả kiêm bù trừ thu ngân sách nhà nước của cơ quan thuế, Kho bạc nhà nước thực hiện chi hoàn trả thuế tiêu thụ đặc biệt của xăng khoáng nguyên liệu dùng để sản xuất, pha chế xăng sinh học theo quy định tại Điều 5 Nghị định số 11/2020/NĐ-CP ngày 20/01/2020 của Chính phủ quy định về thủ tục hành chính thuộc lĩnh vực Kho bạc Nhà nước.
Bộ Tài chính đề xuất quy định này có hiệu lực thi hành kể từ ngày 1/1/2026.
