Theo báo cáo nhanh của Ban chỉ huy phòng chống thiên tai và Tìm kiếm cứu nạn các huyện, thị xã, thành phố, đến 6h sáng 12/9, toàn tỉnh Yên Bái đã có 44 người chết và mất tích. Thiệt hại 22.886 nhà ở, trong đó: sập đổ hoàn toàn 128 nhà. hư hỏng nặng 75 nhà; di dời khẩn cấp 27 nhà; bị sạt lở, taluy ảnh hưởng 874 nhà, còn lại là tốc mái; nhà bị ngập nước: 21.451 nhà. Toàn tỉnh đã di dời người và tài sản để đảm bảo an toàn với 12.391 hộ.
Do mưa lớn, lũ trên sông Thao lên nhanh đã gây ngập lụt sâu tại nhiều khu vực của tỉnh Yên Bái.
Thiệt hại về nông nghiệp: Tổng diện tích cây trồng bị thiệt hại, ảnh hưởng: 4.829 ha, trong đó: lúa 2.924 ha; ngô, rau màu 942 ha, cây công nghiệ (cây dâu) 876 ha; cây lâm nghiệp 86 ha. Chết trên 11.200 con gia cầm, gia súc. Diện tích nuôi cá truyền thống bị lũ tràn qua và vỡ bờ là 199,88 ha và một số thiệt hại khác.
Thiệt hại về cơ sở hạ tầng giao thông: tuyến quốc lộ 32 sạt lở taluy dương 165 điểm sạt, khối lượng 18.271 m3; Quốc lộ 37 là 10 vị trí.
Các tuyến quốc lộ 32C, 2D ngập úng cục bộ nhiều vị trí, nước ngập giảm dần song phụ thuộc vào mức nước rút của sông, hồ.
Các đường tỉnh: Yên Bái - Khe Sang; An Bình - Lâm Giang, Mậu A - Tân Nguyên (ĐT 165), Yên Thế - Vĩnh Kiên (ĐT.170), Khánh Hoà -Minh Xuân (ĐT.171), Hợp Minh - Mỵ, Đại Lịch - Minh An, Văn Chấn - Trạm Tấu (ĐT.174), Mường La - Mù Cang Chải (ĐT.175B), Âu Cơ, Nguyễn Tất Thành, Minh Bảo - Đại Đồng, Sơn Thịnh - Suối Giàng đều có các vị trí sạt ta luy, thậm chí sụt lún, đứt gãy mặt đường.
Về thủy lợi, toàn tỉnh có 25 công trình thủy lợi bị thiệt hại (8 công trình sập, gãy, bồi lấp kênh, 1 công trình trôi đường ống dẫn nước, 1 công trình sạt mái hạ lưu đập, 15 công trình trạm bơm ngập nhà trạm và thiết bị điện). Kè bờ suối Thia sạt lở 40m và vẫn tiếp tục nguy cơ cao sạt lở đê, kè tại địa phận thôn Nậm To, xã Thạch Lương, thị xã Nghĩa Lộ.
Tràn và vỡ các tuyến đê trên địa bàn huyện Trấn Yên: vỡ các đê: Cát Vân, Đê ông Lộc, đê ông Thành thị trấn Cổ Phúc, đê Liên Hiệp xã Minh Quân, đê Hồng Thái xã Nga Quán (70m), đê Phú Thọ xã Việt Thành (60m); tràn các đê: Cầu Đất thị trấn Cổ Phúc, Lan Đình xã Việt Thành.
Thiệt hại nhiều cơ sở vật chất của Trung tâm Y tế huyện Trạm Tấu và hiện đang khắc phục 19 trạm y tế bị ngập.
Ngập lụt 21 trường; sạt ta luy, đổ tường rào, nứt công trình tại 57 trường, điểm trường. Ngày 11/9, toàn tỉnh có 409 trường từ mầm non đến phổ thông cho học sinh nghỉ học.
Nhiều thiệt hại khác về công trình thủy điện, thủy lợi, hạ tầng viễn thông; trong đó có sạt lở taluy âm chân cột ăngten phát sóng của Đài Phát thanh và Truyền hình Yên Bái với khối lượng khoảng 100 m3. Ước thiệt hại ban đầu khoảng 916 tỷ đồng.
