Theo Bộ GD&ĐT, việc xây dựng các quy định chi tiết này xuất phát từ việc Luật Giáo dục đại học đã điều chỉnh nhiều nội dung liên quan đến mô hình quản trị đại học, trong đó bỏ quy định trực tiếp về Hội đồng trường đối với cơ sở giáo dục đại học công lập và giao Bộ trưởng Bộ GD&ĐT quy định cụ thể về cơ cấu, tiêu chuẩn, nhiệm vụ, quyền hạn, cơ chế hoạt động và giám sát của Hội đồng trường đối với cơ sở giáo dục đại học tư thục.
Dự thảo Nghị định dự kiến có hiệu lực từ ngày 1/1/2026, đồng thời bãi bỏ Nghị định số 141/2013/NĐ-CP, Nghị định số 99/2019/NĐ-CP và bãi bỏ Điều 104, 105 của Nghị định số 125/2024/NĐ-CP.
Theo dự thảo, Bộ trưởng Bộ GD&ĐT sẽ có thẩm quyền bổ nhiệm, miễn nhiệm giám đốc, phó giám đốc đại học, đại học quốc gia; hiệu trưởng, phó hiệu trưởng và các chức danh tương đương của các cơ sở giáo dục đại học công lập trực thuộc.
Đối với các cơ sở giáo dục đại học công lập không trực thuộc Bộ, thẩm quyền này thuộc về thủ trưởng cơ quan quản lý trực tiếp.
Đối với cơ sở giáo dục đại học tư thục, hội đồng trường có thẩm quyền quyết định bổ nhiệm giám đốc, hiệu trưởng và các chức danh tương đương sau khi được nhà đầu tư thống nhất bằng văn bản về phương án nhân sự.
Người có thẩm quyền bổ nhiệm cũng đồng thời có thẩm quyền miễn nhiệm, cho thôi giữ chức vụ, điều động, luân chuyển, thuyên chuyển các chức danh lãnh đạo theo quy định.
Về thủ tục, đối với các cơ sở giáo dục đại học công lập, việc bổ nhiệm, miễn nhiệm và điều động lãnh đạo thực hiện theo quy định của pháp luật về viên chức quản lý.
Với cơ sở giáo dục đại học tư thục, hội đồng trường căn cứ tiêu chuẩn nhân sự để lựa chọn, đề xuất phương án nhân sự trình nhà đầu tư; trường hợp hội đồng trường không hoạt động hoặc chưa có hiệu trưởng, nhà đầu tư được giao nhân sự đủ tiêu chuẩn tạm thời đảm nhiệm chức vụ cho đến khi hoàn tất quy trình bổ nhiệm.
Dự thảo cũng yêu cầu các cơ sở giáo dục đại học tư thục phải báo cáo bằng văn bản với Bộ GD&ĐT và UBND cấp tỉnh nơi đặt trụ sở chính trong thời hạn 5 ngày làm việc kể từ khi có thay đổi về nhân sự lãnh đạo.
