Theo quy định cũ tại Quyết định 78/2010/QĐ-TTg, hàng hóa có giá trị dưới 1 triệu đồng được miễn cả thuế nhập khẩu và thuế VAT. Tuy nhiên, từ ngày 18/2/2025, theo Quyết định 01/2025/QĐ-TTg, chỉ còn thuế nhập khẩu được miễn, còn thuế VAT vẫn phải nộp.
Trong giai đoạn chuyển tiếp, do hệ thống hải quan chưa cập nhật phần mềm kịp thời, việc thu thuế VAT với các lô hàng nhỏ này vẫn thực hiện bằng phương thức thủ công, gây bất cập, tốn nhân lực và dễ sai sót. Do đó, Thông tư 29/2025/TT-BTC ra đời nhằm chuẩn hóa quy trình, hiện đại hóa hệ thống thu thuế và đảm bảo thu đúng, thu đủ.
Cục Hải quan sẽ thực hiện thí điểm việc thu thuế VAT tự động từ ngày 9 đến 31/7 với một số doanh nghiệp chuyển phát nhanh. Sau đó, từ 1/8/2025, hệ thống sẽ chính thức áp dụng rộng rãi cho mọi loại hình vận chuyển (hàng không, đường bộ, đường sắt).
Việc triển khai hệ thống tự động không chỉ giảm gánh nặng thủ tục cho doanh nghiệp mà còn giúp nâng cao hiệu quả quản lý thuế đối với hàng hóa giá trị nhỏ – nhóm hàng đang tăng trưởng nhanh cùng với thương mại điện tử xuyên biên giới.
