Đáng chú ý, Nghị định số 369/2025/NĐ-CP sửa đổi, bổ sung Điều 3 Nghị định 36/2025/NĐ-CP về cơ cấu tổ chức của Văn phòng Chính phủ.
Theo quy định mới, cơ cấu tổ chức của Văn phòng Chính phủ giảm từ 18 đơn vị xuống còn 17 đơn vị, gồm:
1- Vụ Tổng hợp.
2- Vụ Pháp luật.
3- Vụ Kinh tế tổng hợp.
4- Vụ Công nghiệp.
5- Vụ Nông nghiệp.
6- Vụ Khoa giáo - Văn xã.
7- Vụ Quan hệ quốc tế.
8- Vụ Nội chính.
9- Vụ Tổ chức công vụ.
10- Vụ Theo dõi công tác thanh tra (Vụ I).
11- Vụ Công tác Quốc hội, Địa phương và Đoàn thể.
12- Vụ Thư ký - Biên tập.
13- Vụ Hành chính.
14- Vụ Tổ chức cán bộ.
15- Cục Chuyển đổi số.
16- Cục Quản trị - Tài vụ.
17- Cổng Thông tin điện tử Chính phủ.
Cổng Thông tin điện tử Chính phủ được sử dụng con dấu hình Quốc huy.
Nghị định số 369/2025/NĐ-CP cũng bỏ cụm từ "kiểm soát thủ tục hành chính" tại Điều 1 Nghị định số 36/2025/NĐ-CP. Như vậy, Văn phòng Chính phủ không còn chức năng về kiểm soát thủ tục hành chính.
Cùng với đó, Nghị định số 369/2025/NĐ-CP cũng bãi bỏ nhiệm vụ, quyền hạn về kiểm soát thủ tục hành chính quy định tại khoản 3 Điều 2 Nghị định số 36/2025/NĐ-CP.
